mysqld_safeのdefaults-fileオプションは先頭に書く

mysqld_safe --user=mysql --defaults-file=/etc/my.cnf &

はダメで

mysqld_safe --defaults-file=/etc/my.cnf --user=mysql &

が正しいのですってよ、奥様！

参考: http://www.mysql.gr.jp/mysqlml/mysql/msg/14030